Sudionici konzorcija Genome 10K na godišnjoj konferenciji, koja se sada održava u New Yorku, najavili su pokretanje međunarodnog projekta "Genomi kralježnjaka", čiji je zadatak prikupiti genom svih 66 tisuća vrsta kralježnjaka koji danas žive na planetu. Gizmodo govori više o ciljevima i projektima.
Američki biolozi David Haussler, Oliver Ryder i Stephen O'Brien 2009. godine osnovali su projekt Genome 10K, čiji je cilj bio sekvenciranje 10 000 genoma kralježnjaka. U početku je u projektu sudjelovalo 55 znanstvenika iz velikih zooloških vrtova, istraživačkih centara i muzeja. U početku nije bilo jasno koliko će vremena trebati za sastavljanje dovoljno kvalitetnih genoma. No, uz cijenu i pojednostavljenje metoda sekvenciranja postalo je jasno da će projekt svoje zadatke dovršiti za nekoliko godina. Tijekom posljednje tri godine sudionici projekta uspoređivali su glavne tehnologije za sekvenciranje DNA i analizu dobivenih rezultata kako bi odabrali onu koja će stvoriti "platinaste genome".
Članovi Genome 10K najavili su jučer pokretanje novog Projekta genoma kralježnjaka, koji za cilj ima prikupljanje muških i ženskih genoma od 66.000 vrsta kralježnjaka. U projektu će sudjelovati 150 znanstvenika koji predstavljaju 50 organizacija iz 12 zemalja. Prema jednom od osnivača projekta Oliveru Ryderu, biolozi će kao rezultat toga moći razumjeti razloge izumiranja vrsta, uključujući i to jesu li u povijesti vrste postojali usko povezani križanja, „uska grla“, uslijed čega se genetska raznolikost vrste smanjila ili se brisanja - mutacije koje se mogu „isključiti“»Geni neophodni za opstanak organizma.
Zajedno s najavom novog projekta, znanstvenici su odmah predstavili prve rezultate njegovog rada: genomi 15 vrsta kralježnjaka, uključujući ugroženu papigu sova kakapo, endemičnu za Novi Zeland i australsku platipu. Ovi i svi drugi genomi koje istraživači planiraju prikupiti bit će objavljeni u javnoj domeni, u bazi podataka Noine arke Genomic.
Sudionici planiraju sekvencirati kratke dijelove genomske DNA i sakupljati sve duže sekvence od njih do cijelog kromosoma, a zatim ih "zalijepiti" pomoću algoritama posebno razvijenih za projekt.
Prije su istraživači mogli čitati genom neke osobe na džepnom sekvenceru veličine pametnog telefona. Uređaj je postavio rekord najduljeg očitanja molekule DNA, uspio je nizati sekvence do 882 tisuće baznih parova.
Ekaterina Rusakova
