Znanstvenici su otkrili obitelj jedinstvenih kratkih ponavljanja u genomu svinje koja ima evolucijske sličnosti sa sličnim ponavljanjima u primata.
Znanstvenici sa Sveučilišta Jilin (Changchun, Kina) i Akademije poljoprivrednih znanosti (Heilongjiang, Kina) sudjelovali su u projektu u suradnji s tvrtkom Firefly BioWorks Corporation (SAD).
Nakon analize strukture i podrijetla PRE-1 (svinjski ponavljajući element, doslovno - "svinjski ponavljajući element"), došli su do zaključka da bi najbliži srodnici primata na bivšem superkontinentu Laurasia mogli biti svinje. Preprint istraživanja objavljen je na poslužitelju bioRxiv 31. kolovoza 2015.
Ispitivani CDP (kratko dispergirano ponavljanje) PRE-1 nalazi se u intergenom području, otprilike 686 ~ 985 baznih parova prije početka gena koji kodira protein koji veže faktor inzulinskog rasta (IGFBP7). Ponovljeni PRE-1 slijed od 299 baznih parova uspoređen je s 40 različitih ponavljanja Alua primata, a pronađene su značajne sličnosti kako u samim sekvencama, tako i u obrascu raspodjele njihovih ponavljanja kroz kromosome.
Predviđena sekundarna struktura RNA ponavlja PRE-1 presavijen u model sličan Alu-ponavljanjima. Konačno, zajedničko podrijetlo PRE-1 i Alu iz takozvane 7SL RNA (RNA za prepoznavanje signala) sugerira njihovu evolucijsku sličnost i pripisalo je svinje obitelji, koja uglavnom uključuje primate.
Prije toga, za izgradnju filogenetskih stabala, znanstvenici su se oslanjali samo na sličnosti i razlike gena, zanemarujući činjenicu da je tijekom evolucije čitav genom doživio promjene, uključujući i one njegovih elemenata koji ne kodiraju proteine ili RNA, a čije značenje znanstvenicima još uvijek u velikoj mjeri nije jasno.
Promotivni video:
Ova studija, temeljena na integriranom pristupu analizi intergenih elemenata, pruža, prema autorima, "vrlo uvjerljive" činjenice iz kojih se mogu izvući evolucijski zaključci. Konkretno, prema tim rezultatima, procijenjeno vrijeme divergencije vrsta pomiče se s 65 na 80-100 milijuna godina.
