Nešto tajanstveno se često utkalo u letove Apolona. Apolon 12 pratila su dva svjetleća NLO-a tijekom njegova tri putanja oko Mjeseca. Misija Apollo 13 bila je potpuno neuspješna. Na mjesecu su ga počele proganjati tajanstvene svjetlosti. 13. travnja 1970. spremnik kisika na brodu neočekivano je eksplodirao, a astronauti su morali napustiti lunarno slijetanje u krater Fra Mauro.
Postoji inačica da je NLO dignuo u zrak spremnik s kisikom, sprečavajući Amerikance da na Mjesec donesu atomsku bombu radi seizmičkih istraživanja. Kao posljedica ove nesreće, astronauti su samo s velikim poteškoćama uspjeli ući u nisku zemaljsku orbitu i vratiti se na svoj matični planet. Misija Apollo 15 promatrala je golemi NLO kako polako leti iznad mjesečeve površine. Konačno, zapovjednik Apolla 16 John Young otkrio je urednu staklenu prizmu u mjesečevoj prašini, koja se procjenjuje na milijarde godina.
1996. godine u Sjedinjenim Državama objavljena je knjiga dr. Edwina Raisa, jednog od autora projekta Apollo 17, pod nazivom "Izgubljeni prostor". Rais je tvrdio da su na ovoj ekspediciji astronauti naišli na stanovnike Mjeseca. Dok su putovali površinom satelita našeg planeta na Roveru, navodno su naišli na malu, otprilike tri metra, kupolastu strukturu, iz koje je iznenada izlilo desetak čudnih stvorenja. Nisu pokušali napasti vozilo, ali ono je odjednom prestalo da se pokorava astronautima. Istodobno, u njihovim je slušalicama zazvučao jasan, zvučan govor, koji je prenijet u Houston, gdje je odmah preveden s latinskog.
Ispostavilo se da su bića astronautima rekla da su napala strani teritorij i da bi trebala ići kući. Čim su svi i sve shvatili, kontrola nad Roverom je obnovljena, a zemljani su pojurili do svog vozila spuštanja s Mjeseca.
